MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens LL3 chromosome

Total Repeats: 73592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017190	AT	3	6	419	424	50 %	50 %	0 %	0 %	384162405
2	NC_017190	CGA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162405
3	NC_017190	CTGG	2	8	567	574	0 %	25 %	50 %	25 %	384162405
4	NC_017190	AT	3	6	607	612	50 %	50 %	0 %	0 %	384162405
5	NC_017190	GAA	2	6	625	630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162405
6	NC_017190	GAA	2	6	667	672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162405
7	NC_017190	A	6	6	697	702	100 %	0 %	0 %	0 %	384162405
8	NC_017190	ATCGG	2	10	775	784	20 %	20 %	40 %	20 %	384162405
9	NC_017190	GCA	2	6	802	807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162405
10	NC_017190	TTTA	3	12	849	860	25 %	75 %	0 %	0 %	384162405
11	NC_017190	G	7	7	862	868	0 %	0 %	100 %	0 %	384162405
12	NC_017190	GTG	2	6	940	945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384162405
13	NC_017190	TCT	2	6	952	957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162405
14	NC_017190	TCA	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162405
15	NC_017190	GAT	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162405
16	NC_017190	AACA	2	8	1079	1086	75 %	0 %	0 %	25 %	384162405
17	NC_017190	GAA	2	6	1123	1128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162405
18	NC_017190	CAAA	2	8	1131	1138	75 %	0 %	0 %	25 %	384162405
19	NC_017190	CCG	2	6	1234	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162405
20	NC_017190	GAAA	2	8	1268	1275	75 %	0 %	25 %	0 %	384162405
21	NC_017190	GTT	2	6	1375	1380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162405
22	NC_017190	GCT	2	6	1423	1428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162405
23	NC_017190	ATT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162405
24	NC_017190	CAG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162405
25	NC_017190	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162405
26	NC_017190	GAA	2	6	1630	1635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162405
27	NC_017190	GA	3	6	1644	1649	50 %	0 %	50 %	0 %	384162405
28	NC_017190	CTG	2	6	1690	1695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162405
29	NC_017190	TGA	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162405
30	NC_017190	AGC	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162405
31	NC_017190	CAG	3	9	1714	1722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162405
32	NC_017190	GAAA	2	8	1725	1732	75 %	0 %	25 %	0 %	384162405
33	NC_017190	ATA	2	6	1749	1754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384162405
34	NC_017190	AAC	2	6	2009	2014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162406
35	NC_017190	TCAT	2	8	2100	2107	25 %	50 %	0 %	25 %	384162406
36	NC_017190	AGA	3	9	2114	2122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162406
37	NC_017190	CGAT	2	8	2140	2147	25 %	25 %	25 %	25 %	384162406
38	NC_017190	TGC	2	6	2164	2169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162406
39	NC_017190	TTC	2	6	2178	2183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162406
40	NC_017190	A	6	6	2196	2201	100 %	0 %	0 %	0 %	384162406
41	NC_017190	AATTT	2	10	2272	2281	40 %	60 %	0 %	0 %	384162406
42	NC_017190	CAT	2	6	2331	2336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162406
43	NC_017190	ATT	2	6	2456	2461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162406
44	NC_017190	CGT	2	6	2537	2542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162406
45	NC_017190	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162406
46	NC_017190	TTA	2	6	2611	2616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162406
47	NC_017190	TTC	2	6	2655	2660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162406
48	NC_017190	GCT	2	6	2666	2671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162406
49	NC_017190	TCG	2	6	2728	2733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162406
50	NC_017190	CTT	2	6	2770	2775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162406
51	NC_017190	GA	3	6	2783	2788	50 %	0 %	50 %	0 %	384162406
52	NC_017190	CAA	2	6	2795	2800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162406
53	NC_017190	TCA	2	6	2844	2849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162406
54	NC_017190	AGT	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162406
55	NC_017190	GCTG	2	8	2885	2892	0 %	25 %	50 %	25 %	384162406
56	NC_017190	TTCA	2	8	2921	2928	25 %	50 %	0 %	25 %	384162406
57	NC_017190	AT	3	6	2936	2941	50 %	50 %	0 %	0 %	384162406
58	NC_017190	ATG	2	6	3028	3033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162406
59	NC_017190	AAAC	2	8	3073	3080	75 %	0 %	0 %	25 %	384162406
60	NC_017190	CGG	2	6	3291	3296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162407
61	NC_017190	GAGC	2	8	3315	3322	25 %	0 %	50 %	25 %	384162407
62	NC_017190	CAA	2	6	3336	3341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162407
63	NC_017190	CGC	2	6	3355	3360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162407
64	NC_017190	GTC	2	6	3418	3423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162407
65	NC_017190	GC	3	6	3489	3494	0 %	0 %	50 %	50 %	384162408
66	NC_017190	ATC	2	6	3526	3531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162408
67	NC_017190	CGCAC	2	10	3596	3605	20 %	0 %	20 %	60 %	384162408
68	NC_017190	GAAG	2	8	3655	3662	50 %	0 %	50 %	0 %	384162408
69	NC_017190	TGA	2	6	3665	3670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162408
70	NC_017190	A	6	6	3709	3714	100 %	0 %	0 %	0 %	384162408
71	NC_017190	AGC	2	6	3743	3748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162408
72	NC_017190	TCAG	2	8	3755	3762	25 %	25 %	25 %	25 %	384162408
73	NC_017190	GAG	3	9	3834	3842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384162408
74	NC_017190	A	6	6	3905	3910	100 %	0 %	0 %	0 %	384162408
75	NC_017190	AGC	2	6	4005	4010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162408
76	NC_017190	AAAAGA	2	12	4197	4208	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384162408
77	NC_017190	ATT	2	6	4227	4232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162408
78	NC_017190	GAT	2	6	4246	4251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162408
79	NC_017190	T	6	6	4256	4261	0 %	100 %	0 %	0 %	384162408
80	NC_017190	CAG	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162408
81	NC_017190	ACG	2	6	4312	4317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162408
82	NC_017190	GAA	2	6	4357	4362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162408
83	NC_017190	GAT	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162408
84	NC_017190	GAT	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162408
85	NC_017190	CAC	2	6	4470	4475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384162408
86	NC_017190	AGTGA	2	10	4548	4557	40 %	20 %	40 %	0 %	384162408
87	NC_017190	GAC	2	6	4593	4598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162409
88	NC_017190	TCG	2	6	4621	4626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162409
89	NC_017190	GAA	2	6	4665	4670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162409
90	NC_017190	GACA	2	8	4677	4684	50 %	0 %	25 %	25 %	384162409
91	NC_017190	GAAA	2	8	4685	4692	75 %	0 %	25 %	0 %	384162409
92	NC_017190	AGT	2	6	4694	4699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162409
93	NC_017190	CCGT	2	8	4701	4708	0 %	25 %	25 %	50 %	384162409
94	NC_017190	AT	4	8	4747	4754	50 %	50 %	0 %	0 %	384162409
95	NC_017190	GAA	2	6	4781	4786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162409
96	NC_017190	CAG	2	6	4883	4888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162410
97	NC_017190	ATG	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162410
98	NC_017190	TCG	2	6	5010	5015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162410
99	NC_017190	ACA	2	6	5016	5021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162410
100	NC_017190	CGGT	2	8	5118	5125	0 %	25 %	50 %	25 %	384162410
101	NC_017190	TCA	2	6	5160	5165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162410
102	NC_017190	TTC	2	6	5172	5177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162410
103	NC_017190	CGG	2	6	5218	5223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162410
104	NC_017190	AAC	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162410
105	NC_017190	TCAT	2	8	5592	5599	25 %	50 %	0 %	25 %	384162410
106	NC_017190	TTGCA	2	10	5649	5658	20 %	40 %	20 %	20 %	384162410
107	NC_017190	GGC	2	6	5720	5725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162410
108	NC_017190	AAG	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162410
109	NC_017190	TGA	2	6	5824	5829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162410
110	NC_017190	GA	3	6	5833	5838	50 %	0 %	50 %	0 %	384162410
111	NC_017190	CAT	2	6	5851	5856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162410
112	NC_017190	TTC	2	6	5947	5952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162410
113	NC_017190	CTT	2	6	5969	5974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162410
114	NC_017190	GGC	2	6	6037	6042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162410
115	NC_017190	A	6	6	6044	6049	100 %	0 %	0 %	0 %	384162410
116	NC_017190	TTC	2	6	6118	6123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162410
117	NC_017190	GCGG	2	8	6170	6177	0 %	0 %	75 %	25 %	384162410
118	NC_017190	GGGAC	2	10	6190	6199	20 %	0 %	60 %	20 %	384162410
119	NC_017190	TC	3	6	6271	6276	0 %	50 %	0 %	50 %	384162410
120	NC_017190	TTA	2	6	6413	6418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162410
121	NC_017190	TTC	2	6	6422	6427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162410
122	NC_017190	ATT	2	6	6446	6451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162410
123	NC_017190	GCC	2	6	6478	6483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162410
124	NC_017190	GCA	2	6	6496	6501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162410
125	NC_017190	AGC	2	6	6534	6539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162410
126	NC_017190	TGA	2	6	6541	6546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162410
127	NC_017190	AC	3	6	7023	7028	50 %	0 %	0 %	50 %	384162411
128	NC_017190	TCAG	2	8	7050	7057	25 %	25 %	25 %	25 %	384162411
129	NC_017190	TCCT	2	8	7070	7077	0 %	50 %	0 %	50 %	384162411
130	NC_017190	AATG	2	8	7165	7172	50 %	25 %	25 %	0 %	384162411
131	NC_017190	A	6	6	7202	7207	100 %	0 %	0 %	0 %	384162411
132	NC_017190	TCG	2	6	7218	7223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162411
133	NC_017190	ACC	2	6	7242	7247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384162411
134	NC_017190	TTG	2	6	7317	7322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162411
135	NC_017190	TTCGG	2	10	7337	7346	0 %	40 %	40 %	20 %	384162411
136	NC_017190	TCC	2	6	7558	7563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384162411
137	NC_017190	CGGC	2	8	7668	7675	0 %	0 %	50 %	50 %	384162411
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141	NC_017190	A	7	7	7859	7865	100 %	0 %	0 %	0 %	384162411
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145	NC_017190	CTG	2	6	8009	8014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162411
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150	NC_017190	TTG	2	6	8349	8354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162411
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245	NC_017190	A	6	6	18592	18597	100 %	0 %	0 %	0 %	384162414
246	NC_017190	A	6	6	18616	18621	100 %	0 %	0 %	0 %	384162414
247	NC_017190	TACA	2	8	18648	18655	50 %	25 %	0 %	25 %	384162414
248	NC_017190	ATG	2	6	18722	18727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162414
249	NC_017190	GAT	2	6	18753	18758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162414
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251	NC_017190	AAT	2	6	19022	19027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384162415
252	NC_017190	GGC	2	6	19080	19085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162415
253	NC_017190	TCA	2	6	19087	19092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162415
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257	NC_017190	AATG	2	8	19235	19242	50 %	25 %	25 %	0 %	384162415
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264	NC_017190	TGT	2	6	19643	19648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162415
265	NC_017190	TGC	2	6	19655	19660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162415
266	NC_017190	CGG	2	6	19661	19666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162415
267	NC_017190	CTG	2	6	19678	19683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162415
268	NC_017190	TGA	2	6	19693	19698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162415
269	NC_017190	TTG	2	6	19777	19782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162415
270	NC_017190	CGGG	2	8	20065	20072	0 %	0 %	75 %	25 %	384162416
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273	NC_017190	GTT	2	6	20235	20240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162416
274	NC_017190	TGA	2	6	20306	20311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162416
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276	NC_017190	CG	3	6	20334	20339	0 %	0 %	50 %	50 %	384162416
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280	NC_017190	TGA	2	6	20943	20948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162417
281	NC_017190	A	6	6	20948	20953	100 %	0 %	0 %	0 %	384162417
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286	NC_017190	ATT	2	6	21055	21060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162417
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288	NC_017190	AAG	2	6	21091	21096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162417
289	NC_017190	TGA	2	6	21099	21104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162417
290	NC_017190	AGA	2	6	21192	21197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162417
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294	NC_017190	CGG	2	6	21533	21538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162417
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298	NC_017190	GCCG	2	8	21643	21650	0 %	0 %	50 %	50 %	384162417
299	NC_017190	CAA	2	6	21684	21689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162417
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324	NC_017190	CCG	2	6	23142	23147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162418
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340	NC_017190	TCT	2	6	24471	24476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162420
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360	NC_017190	TA	3	6	26051	26056	50 %	50 %	0 %	0 %	384162421
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364	NC_017190	GC	3	6	26327	26332	0 %	0 %	50 %	50 %	384162421
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374	NC_017190	ATAA	2	8	26833	26840	75 %	25 %	0 %	0 %	384162422
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378	NC_017190	T	6	6	26904	26909	0 %	100 %	0 %	0 %	384162422
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381	NC_017190	ATGA	2	8	27074	27081	50 %	25 %	25 %	0 %	384162423
382	NC_017190	GA	3	6	27094	27099	50 %	0 %	50 %	0 %	384162423
383	NC_017190	GAA	2	6	27115	27120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162423
384	NC_017190	TG	3	6	27324	27329	0 %	50 %	50 %	0 %	384162423
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389	NC_017190	GTG	2	6	27452	27457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384162423
390	NC_017190	GAA	2	6	27470	27475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162423
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